Il museo offre una documentazione dettagliata dell’insediamento umano nel territorio compreso tra i Colli Euganei a nord e il corso dell’Adige a sud, seguendo il tema della relazione uomo–ambiente. L’itinerario museale prevede un percorso a ritroso nella storia, che parte dalla meccanizzazione agraria di fine '700 e giunge fino alla fase preistorica; tale criterio espositivo sottolinea la stretta connessione tra l’età antica e l’età moderna manifestata dal territorio della Bassa Padovana, una regione che, adesso come in passato, ha saputo dimostrare una forte individualità culturale.